Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms