Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHF8Q9UPP1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms