Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNRF3Q9ULT6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms