Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms