Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBD1Q9UIS9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms