Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms