Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms