Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms