Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms