Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms