Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP4Q9NRJ4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms