Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms