Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms