Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms