Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1BQ9H0U4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms