Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFRA4Q9GZZ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms