Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms