Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUH8

BEGAIN, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEGAINQ9BUH8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEGAINQ9BUH8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEGAINQ9BUH8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms