Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms