Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms