Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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UBE2E2Q96LR5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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UBE2E2Q96LR5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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UBE2E2Q96LR5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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UBE2E2Q96LR5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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UBE2E2Q96LR5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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UBE2E2Q96LR5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2E2Q96LR5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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