Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms