Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms