Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEO1Q92859 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms