Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms