Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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