Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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