Protein–RNA interactions for Protein: Q8N616

LINC00311, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00311, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00311Q8N616 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00311Q8N616 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms