Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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LRRC18Q8N456 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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LRRC18Q8N456 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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LRRC18Q8N456 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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