Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms