Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms