Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms