Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RGMBQ6NW40 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms