Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms