Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q5VSD8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q5VSD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms