Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms