Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms