Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSP90AB4PQ58FF6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HSP90AB4PQ58FF6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms