Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA8Q53HL2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms