Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms