Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NBPF1Q3BBV0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NBPF1Q3BBV0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NBPF1Q3BBV0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBPF1Q3BBV0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBPF1Q3BBV0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBPF1Q3BBV0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NBPF1Q3BBV0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBPF1Q3BBV0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBPF1Q3BBV0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBPF1Q3BBV0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms