Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms