Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms