Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIBQ15653 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIBQ15653 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms