Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms