Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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UBE4AQ14139 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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UBE4AQ14139 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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UBE4AQ14139 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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UBE4AQ14139 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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UBE4AQ14139 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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