Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms