Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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