Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms