Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms